Chùa Xá Lợi được hoàn thành năm 1958, là một công trình Phật giáo mang kiến trúc hiện đại nhưng vẫn giữ sắc thái văn hóa dân tộc — và gắn với nhiều dấu mốc quan trọng của Phật giáo Việt Nam.
Được xây dựng làm nơi phụng thờ Xá lợi Phật và làm hội quán của Hội Phật học Nam Việt, Xá Lợi từ đầu đã mang trong mình hai vai trò: một không gian tâm linh và một trung tâm Phật học. Công trình khởi công ngày 5-8-1956 dưới sự đôn đốc của hai kỹ sư Dư Ngọc Ánh và Hà Tố Thuận, thi công theo bản vẽ của hai kiến trúc sư Trần Văn Đường và Đỗ Bá Vinh, và được khánh thành trọng thể trong các ngày 2, 3, 4 tháng 5 năm 1958.
Người có công vận động thành lập Hội Phật học Nam Việt và đứng ra xây dựng chùa là cư sĩ Chánh Trí Mai Thọ Truyền (1905–1973). Hòa thượng Khánh Anh, Pháp chủ Giáo hội Tăng già Nam Việt, sau đó đặt tên “Xá Lợi” cho hợp lòng người mộ đạo.